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該公司涉嫌違法違規，已經被深圳政府查封，法人總經理等人員被收監。在這種情況下，我司想咨詢下，未收到的款項部分所繳納的稅款，是否可以申請退回。或者應該咨詢哪個部門，走哪個流程。
2017-2019年度，我公司和深圳一家公司發生業務往來。在此期間，我司累積開具了約97萬增值稅專用發票給對方，但是至今未收到對方公司回款。此前得知，該公司涉嫌違法違規，已經被深圳政府查封，法人總經理等人員被收監。在這種情況下，我司想咨詢下，未收到的款項部分所繳納的稅款，是否可以申請退回。或者應該咨詢哪個部門，走哪個流程。
根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》規定：
第十九條 增值稅納稅義務發生時間：
(一)發生應稅銷售行為，為收訖銷售款項或者取得索取銷售款項憑據的當天;先開具發票的，為開具發票的當天。
(二)進口貨物，為報關進口的當天。
增值稅扣繳義務發生時間為納稅人增值稅納稅義務發生的當天。
根據《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）規定：
第四十五條 增值稅納稅義務、扣繳義務發生時間為：
（一）納稅人發生應稅行為并收訖銷售款項或者取得索取銷售款項憑據的當天；先開具發票的，為開具發票的當天。
收訖銷售款項，是指納稅人銷售服務、無形資產、不動產過程中或者完成后收到款項。
取得索取銷售款項憑據的當天，是指書面合同確定的付款日期；未簽訂書面合同或者書面合同未確定付款日期的，為服務、無形資產轉讓完成的當天或者不動產權屬變更的當天。
（二）納稅人提供租賃服務采取預收款方式的，其納稅義務發生時間為收到預收款的當天。
（三）納稅人從事金融商品轉讓的，為金融商品所有權轉移的當天。
（四）納稅人發生本辦法第十四條規定情形的，其納稅義務發生時間為服務、無形資產轉讓完成的當天或者不動產權屬變更的當天。
（五）增值稅扣繳義務發生時間為納稅人增值稅納稅義務發生的當天。
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