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該項費用是否可作為一般費用列支，而不作為福利費列支
公司新員工入職發生的入職體檢費是否可以作為一般費用在所得稅前扣除。《企業所得稅法實施條例》第四十條規定的企業職工福利費，包括以下內容：“……（二）為職工衛生保健、生活、住房、交通等所發放的各項補貼和非貨幣性福利，……”新員工入職體檢系為保證新員工滿足入職條件而發生，并非為職工衛生保建所發放的補貼，那該項費用是否可作為一般費用列支，而不作為福利費列支。
根據《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》（中華人民共和國國務院令第512號）第四十條規定：“企業發生的職工福利費支出，不超過工資、薪金總額14%的部分，準予扣除。”
另根據《國家稅務總局關于企業工資薪金及職工福利費扣除問題的通知》（國稅函〔2009〕3號）規定：“三、關于職工福利費扣除問題
《實施條例》第四十條規定的企業職工福利費，包括以下內容：
……
（二）為職工衛生保健、生活、住房、交通等所發放的各項補貼和非貨幣性福利，包括企業向職工發放的因公外地就醫費用、未實行醫療統籌企業職工醫療費用、職工供養直系親屬醫療補貼、供暖費補貼、職工防暑降溫費、職工困難補貼、救濟費、職工食堂經費補貼、職工交通補貼等。
（三）按照其他規定發生的其他職工福利費，包括喪葬補助費、撫恤費、安家費、探親假路費等。”
因此，職工的體檢費應計入職工福利費，按照職工福利費的標準進行扣除。
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